Agar pelaksanaan tugas dan wewenang kepemimpinan Majelis Jemaat dapat mencapai anggota secara lebih penuh, maka berdasarkan imamat am orang percaya dibentuk pengkhususan bidang pelayanan yang dilayani oleh badan pembantu.

Yang dimaksud dengan badan pembantu adalah Komisi, Badan atau Panitia dan Yayasan.

Komisi dibentuk dan diangkat oleh Majelis Jemaat untuk sebuah bidang pelayanan khusus yang bersifat tetap. Dengan demikian, komisi bertanggung jawab atas segala pelaksanaan tugas, berdasarkan wewenang yang diterimanya, kepada Majelis Jemaat. Masa periode kepengurusan komisi adalah dua tahun.

Melihat kebutuhan atas gereja kami, maka saat ini ada lima komisi yang telah dibentuk. Masing-masing dari mereka adalah:
- Komisi Anak (KA)
- Komisi Pemuda dan Remaja (KPR)
- Komisi Musik dan Ibadah (Komida)
- Komisi Dewasa (KD)
- Komisi Kesaksian dan Pelayanan (KesPel)
- Pelayanan Khusus Mahasiswa Baru (PKMB)

Sesuai dengan nama-nama mereka, tiap-tiap komisi bertanggung jawab atas kehidupan dan pelayanan kepada anak-anak, pemuda/remaja, musik dan ibadah, orang dewasa dan kehidupan kesaksian/pelayanan.